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  • 西安地区肠杆菌科细菌的超广谱β-内酰胺酶基因型的研究

    2011年1月10日 09:24 作者:徐灵彬,刘原,王香玲
    【摘要】  目的 测定西安地区肠杆菌科细菌中的超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases, ESBL)的基因型。方法 在西安市的5所医院中随机选取产ESBL的肠杆菌科细菌25株(共125株),采用PCR方法特异性扩增TEM、SHV和CTX-M型酶的基因片段。结果 在125株产ESBL菌中,有33株扩增出TEM型酶基因片段;有27株扩增出特异性SHV型酶基因片段;有49株扩增出特异性的CTX-M型酶基因片段;共有22株细菌同时扩增出两种以上的酶基因片段。结论 在西安地区的ESBL肠杆菌科细菌中CTX-M型酶较为流行。教育教学论文发表
    z]O3I/A J4eR0v0中国论文网-N l#\|&q)t'P
    【关键词】  肠杆菌科细菌;超广谱β-内酰胺酶;基因型
    8t4@}] OMK%q:y0中国论文网O(k*pVC:U1W
      ABSTRACT: Objective  To study the genotypes of ESBL-producing Enterobacteriaceae in Xi’an city. Methods  Totally 125 ESBL-producing nterobacteriaceae strains were randomly selected from five hospitals of Xi’an City, and TEM-type, SHV-type and CTX-M-type ESBL genes were amplified by PCR. Results  Among the 125 ESBL-producing Enterobacteriaceae strains, TEM-type ESBL genes were amplified from 33 strains, SHV-type ESBL genes were amplified from 26 strains, CTX-M-type ESBL genes were amplified from 49 strains, and two or more type ESBL genes were amplified from 22 strains. Conclusion  CTX-M-type ESBL are prevalent in ESBL-producing Enterbacteriaceae in Xi’an City.
    /a)_LEWd0
    k:H1@%I0{2W*tx0  KEY WORDS: enterobacteriaceae; extended-spectrum β-lactamases; genotype教育教学论文发表
    :A&c7}u.n| Z0中国论文网;R.]c%a ?7|w-r0P^*jm
      产生超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases, ESBL)是肠杆菌科细菌对第三代头孢菌素耐药的最主要机制。肠杆菌科细菌特别是肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌是产生ESBL的最主要细菌[1]。为了解西安市产ESBL肠杆菌科细菌中ESBL基因型的流行情况,我们对2002年9月至2003年8月西安市5所三甲医院分离到的部分产ESBL肠杆菌科细菌进行了基因型的测定。
    4Cg d.p7G0中国论文网pS@4NQYrwx,c6B
      1  材料与方法中国论文网F`0O_ h@ B)_'xu_
    中国论文网u f,kbf
      1.1  实验的菌株中国论文网3}h#hQ.fx&E
     中国论文网%H{P6}r.@m]%y
      2002年9月至2003年8月从西安交通大学医学院第二附属医院、第四军医大学唐都医院、陕西省人民医院、西安市中心医院、西安市儿童医院5所医院的细菌室分离出非重复肠杆菌科细菌1 518株,经表型筛选和确证试验,共检出产ESBL菌株283株[2]。对每所医院的产ESBL菌株按分离的先后顺序进行编号,以随机数字法在每所医院随机选择25株菌株进行研究。细菌的鉴定由各医院细菌室独立进行,使用全自动化微生物鉴定仪Vitek60或Vitek32完成。教育教学论文发表 中国论文网 `O\`C4{5w}o"{;XJ
    中国论文网8X1?#Q0JqiB
      1.2  模板的制备
    H2F4P fX6z}DV0 
    %Y6x.|e4rC^'P0  取单个菌落接种于5 mL LB肉汤中,于37 ℃振荡培养20 h。取1.5 mL菌悬液在4 ℃ 13 000 r/min条件下离心5 min,弃上清。在室温下使细菌沉淀干燥5 min,加入500 μL的无菌去离子水,振荡混悬。在95 ℃水浴中加热10 min后,4 ℃ 13 000 r/min离心5 min除去细胞碎片,将上清移入另一离心管中,此上清即为制备的模板DNA。中国论文网9[YC4Qw,x
    中国论文网} Y8~6x sl
      1.3  引物的设计
    @\P C.R4W0
    ~r9i$|cyDr0  在美国国家生物技术信息中心上查找各型ESBL的基因序列,使用引物设计软件Primer 3设计引物(表1)。引物由上海生工生物技术有限公司合成。表1  PCR反应所用的引物(略)中国论文网 qfQt5^-O+P[;jB

    X p3f g5B'x0  1.4  PCR
    7SCCv%[:kp)o0
    $_)@:k"_jhp&H,e1S0  PCR在DNA热循环仪(DNA Thermal Cycler 480)上进行。三型酶的扩增条件相同。反应总体积为50 μL,其中10×Buffer为5 μL;dNTP混合物,各组分均为0.2 mmol/L;Taq酶2u;左右侧引物各0.5 μmol/L;氯化镁浓度为2.0 mol/L;模板2 μL。短暂离心混合物后,加入矿物油30 μL。PCR循环条件为93 ℃变性1 min,55 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,共30个循环。在首个循环前于93 ℃预变性5 min。循环结束后,于72 ℃再延伸10 min。整个反应结束后,将PCR仪置于4 ℃环境中。教育教学论文发表 中国论文网7X7CA%@,k`
    中国论文网5?$M2Qji(xu`
      1.5  琼脂糖电泳 中国论文网 MUkSjF

    )b"Y q:la8g0  在含溴化乙锭(浓度为0.5 μmol/L)的琼脂糖凝胶中电泳分离PCR反应产物。电泳缓冲液为0.5×TBE Buffer,电泳后紫外灯下观察结果。中国论文网@;l2H`2gt1KH
    中国论文网,I*{.WT1d6? d
      1.6  质量控制
    n'B6I3Q4@2\-c8l"m^^ G0 
    "[w[R1w I#H0  SHV型酶的基因测定选用肺炎克雷伯菌ATCC700603为阳性对照,大肠埃希菌ATCC25922为阴性对照,TEM型酶以及CTX-M型酶基因测定选用肺炎克雷伯菌ATCC700603为阴性对照。
    &o%[ufz,qR0
    k&?3O(VoCv9U:G-i^0  2  结果中国论文网-Tz~S2ct w^

    L+}m9xqo$Ls S,k0  2.1  细菌分布 中国论文网Od#\P&PmDG2Rv

    c d9m'oUg W-y0  在测定的125株细菌中大肠埃希菌52株,肺炎/产酸克雷伯菌47株,阴沟肠杆菌9株,产气肠杆菌7株,其他肠杆菌科细菌10株。
    vP2ozw:e02.2  TEM型酶基因的扩增结果
    Hh;ux[*wc8hk0
    +c%] j1Ve$}0  125株细菌中,有33株细菌扩增出特异性TEM型酶基因片段,其中有大肠埃希菌23株,肺炎克雷伯菌5株,产酸克雷伯菌1株,阴沟肠杆菌2株,产气肠杆菌2株。肺炎克雷伯菌ATCC700603中未扩增到特异的TEM酶基因片段(图1)。教育教学论文发表
    "z @8T'f)~g"m0
    #L0Mv3[ o[0  2.3  SHV型酶基因的扩增结果 中国论文网-x/eyYK#t

    LI|G-tJ0  125株细菌中,有27株菌扩增出特异性SHV型酶基因片段,其中肺炎克雷伯菌13株,产酸克雷伯菌8株,大肠埃希菌5株,阴沟肠杆菌1株。肺炎克雷伯菌ATCC700603扩增出特异性SHV型酶基因片段,而大肠埃希菌ATCC25922未扩增出特异性基因片段(图2)。
    ITR \j0
    R4oz I-zok,l\7|0  2.4  CTX-M型酶基因的扩增结果
    S!i9Hu m:[1Qe3@F[0 
    #i7fj'w'B#\_5y y0  125株细菌中,有49株菌扩增出特异性CTX-M型酶基因片段,其中大肠埃希菌29株,肺炎克雷伯菌6株,产酸克雷伯菌5株,阴沟肠杆菌4株,产气肠杆菌2株,弗氏柠檬酸杆菌、福氏志贺菌和普通变形杆菌各1株。在肺炎克雷伯菌 ATCC700603中未扩增到特异的CTX-M型酶基因片段(图3)。
    Z g['WUx@g/fe0
    gZ1Q A(b!^7H"] G;M0  2.5  同时扩增出两种基因的细菌
    's2bBi-f!@0
    i~n^!l\&Y,\j0  在125株细菌中,有1株大肠埃希菌同时扩增出TEM、SHV和CTX-M三型酶基因片段;同时扩增出TEM和SHV酶基因片段的细菌有5株,其中大肠埃希菌2株,肺炎克雷伯菌2株,阴沟肠杆菌1株;同时扩增出SHV和CTX-M酶基因片段的细菌有6株,其中大肠埃希菌2株,阴沟肠杆菌4株;同时扩增出TEM和CTX-M型酶基因片段的细菌共10株,其中大肠埃希菌8株,肺炎克雷伯菌1株,产气肠杆菌1株。教育教学论文发表
    {;EOCw?5d;Jae0中国论文网 M|_ Q$P/Q8t
      3  讨 论
    f,lIi,^V;s+`k)l0  
    dR%lU;Ni(Y"iC0  文献报道,ESBL是细菌产生的能水解大多数青霉素、头孢菌素和氨曲南等β-内酰胺类抗生素且活性能被酶抑制剂(如克拉维酸、舒巴坦)抑制的一类β-内酰胺酶[3]。它是一种丝氨酸蛋白酶,属于分子分型的A型酶,功能分型的2be型酶。根据ESBL基因和蛋白质氨基酸序列的同源性将其分为四类:TEM型、 SHV型、CTX-M型、其他型。中国论文网v!V#^xh5Q&Q"s
         
    %a!bac8n:Z0  在125株ESBL阳性菌株中,有33株扩增出特异性的TEM酶基因片段,检出率为 26.40%。在产ESBL大肠埃希菌中,其检出率为44.23%(23/52),而在克雷伯菌属中检出率仅为12.76%(6/47)。这说明在西安地区TEM型酶主要在大肠埃希菌中流行。这与国内外文献报道的结果一致[3-4]。中国论文网$^+x UxE o_I
      
    8c.a-flE7|2JS9F0  在125株ESBL阳性菌株中,有27株菌扩增出特异性SHV型酶基因片段。SHV型酶检出率为21.60%。在27株产SHV酶细菌中肺炎/产酸克雷伯菌21株,大肠埃希菌5株,阴沟肠杆菌1 株。产ESBL肺炎/产酸克雷伯菌中,SHV型酶检出率为44.68%,而在产ESBL大肠埃希菌中,检出率仅为9.62%。因此,在西安市产ESBL克雷伯菌属中,SHV酶比较流行,与文献报道的广州和台湾情况相同[5-6]。这种情况可能与SHV-1在肺炎克雷伯菌中广泛存在有关[3]。中国论文网$ry J"F+mF8G N_
      中国论文网Jn-w^9M#^
      在125株ESBL阳性菌株中,有49株菌扩增出特异性CTX-M型酶基因片段。CTX-M型酶的检出率为39.20%。因此,在西安地区产ESBL菌中,CTX-M型酶较为流行。这可能与本地区大量使用头孢噻肟和头孢曲松有一定的关系。产ESBL肺炎/产酸克雷伯菌中,CTX-M型酶检出率为 23.40%,而在产ESBL大肠埃希菌中,检出率仅为55.77%。此结果与文献报道的亚洲地区CTX-M型ESBL比较流行相符[6-7],而且关于此型酶的流行国内其他地区报道也比较多[5,8]。教育教学论文发表 中国论文网y4V`,L'p&B,in+p
      
    P"s6\Cw0  在我们研究的125株细菌中,有22株细菌同时扩增出两种以上的酶基因片段。这与文献报道的多数产ESBL菌株同时携带2种以上β-内酰胺酶的结果相符[4-9]。另外,尚有38株细菌既没有扩增出SHV型酶基因,也没有扩增出CTX-M及TEM型酶基因。它们可能产生的是其他型ESBL。经过PCR只能对细菌产哪一型酶进行分析,并不能明确细菌产生的是哪一个酶。若要明确这一问题,还需对扩增产物纯化后进行碱基序列的分析。中国论文网#dMn&CWE {3s

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